这主要与虹膜上的黑色素有关。黑色素为狗狗的皮肤、毛发和眼睛提供了颜色。黑色素越多，眼睛越黑，黑色素越少，黑色素的扩散就会导致眼睛颜色不一样。当缺乏黑色素时，它可能变成浅色的眼睛，如蓝色和绿色。而黑色素泛滥成灾，会产生褐眼等黑眼圈。有些可能是先天性的，但也可能是后天导致的。
毛遮住眼睛的狗
毛能遮住眼睛的常见狗狗有藏獒、波利犬、古代牧羊犬、阿富汗猎犬、蝴蝶犬、博美犬、西施犬、马尔济斯犬等，这八种狗狗的毛发都很长，但体型不一样，平时需要及时的给它们修剪毛发，不然会给眼部造成危害。
红色眼睛的狗
红眼狗很常见，最典型的是中国沙皮，还有个别高山雪獒，“粉红眼”哈士奇。拉布拉多被项圈拴的太紧时还使劲拖着主人超前走，也会短暂性红眼，而且非常红。