1、导致生殖器溃疡、出血：湿疣病变增大、增多后，可引起局部的异物和不适感。由于湿疣发病的部位多在包皮内、尿道口、阴唇、阴道内、肛周等，这些部位容易受微生物感染，导致病变部位的溃疡、化脓、出血、疼痛和肿胀。
2、湿疣癌变：恶性肿瘤是湿疣最严重的并发症。HPV16、18型感染后，假如医治不迅速的，在将来很可能导致阴茎癌、宫颈癌等恶性肿瘤，早期完全医治是预防湿疣癌变的有效方法。
3、心理负担沉重从而影响家庭和睦：湿疣属性病范畴，倘若被确诊，不少病人会背上沉重的心理负担。当夫妻间一方患病，双方便相互猜疑，导致家庭不和睦，甚至很可能导致一场婚姻危机。